1)在检测拷贝数的时候,GC含量低或者高的区域,其覆盖度小于GC含量中等的,但不意味着仅仅根据测序的覆盖度,就认为GC含量中等的拷贝数比高/低GC含量区域的高。2)在做RNA测序分析的时候,GC含量高/低的区域reads数少,并不一定说明这个基因的表达量低。3)在做基因组拼接的时候,因为GC偏好的 … See more 测序中GC偏好不均衡的结果来源于多个因素,比如对文库进行PCR扩增的时候,cluster簇扩增的时候,测序的时候,不同实验室之间,实验批次之间,不同的样本类型等等。这些因素 … See more 有研究表明在需要考虑GC偏好带来的影响的实验中,通过GC校正能显著改善结果。 See more Web解释:对所有reads的每个位置,统计GC含量。红线是实际情况,蓝线是理论分布(正态分布,均值不一定在50%,而是由平均GC含量推断的)。 红线是实际情况,蓝线是理论分布(正态分布,均值不一定在50%,而是由平 …
多组学分析 GC含量与测序深度 - 知乎 - 知乎专栏
Webreads with adapter trimmed: 206061. bases trimmed due to adapters: 7694138 ... 再次使用fastqc进行质控,发现前11个碱基的GC含量有问题 ... WebSep 1, 2024 · -简化了DNA样品的制备过程;-灵敏度高,可以读取单个分子;-不需要进行PCR扩增,可避免了PCR扩增产生的偏倚和误差;-可用于RNA-seq或RNA直接测序;-对GC含量的敏感性更低,对具有极端GC含量的DNA或基因组测序效率更高;-所需的试剂和操作步骤较少,只需简单的 ... florida movers and warehousemen\u0027s association
根据sam文件计算reads的GC含量 - CSDN博客
WebApr 26, 2024 · 拿到数据后,先对数据进行质量评估,除了跑下Fastqc看下测序质量外,还需要统计 测序reads数目、mapping ratio、coverage、depth 。. 现在一般human全外显子 … WebNov 12, 2024 · perl:计算fasta的GC含量 导读. 我的小骆驼已经六岁了,这几天才自己学着走路。 一、目的. 我的fasta文件是下面那个样子,我要统计每条序列的GC碱基与该序列的总碱基比。顺便比较一下每条序列的GC占比与整个fasta文件的GC占比的大小,结果是下下面那个 … WebApr 12, 2024 · GC-CuSn7ZnPb铜材是一种铜合金,也被称为锡青铜。它的化学成分包含铜、锡、锌和铅,其中银的含量介于6.0-8.0%之间,锌的含量介于1.5-4.0%之间,铅的含量为0.05%以下。这种铜合金具有很好的机械性能和耐磨性能,因此被广泛应用于制造机械零件、轴承、齿轮、轴套、管道等等。 florida move guide by ron stack